Here is the lines to add to the ChooseYourAliens mod. Add these to the XComDisableAliens.ini file to disable all the aliens in this pack. Or be more selective and pick and choose.

+DisableAlien=MutonM2_LW
+DisableAlien=MutonM3_LW
+DisableAlien=ViperM2_LW
+DisableAlien=ViperM3_LW
+DisableAlien=ArchonM2_LW
+DisableAlien=SectoidM2_LW
+DisableAlien=AdvMec_M3_LW
+DisableAlien=NajaM1
+DisableAlien=NajaM2
+DisableAlien=NajaM3
+DisableAlien=SidewinderM1
+DisableAlien=SidewinderM2
+DisableAlien=SidewinderM3
+DisableAlien=AdvGrenadierM1
+DisableAlien=AdvGrenadierM2
+DisableAlien=AdvGrenadierM3
+DisableAlien=AdvRocketeerM1
+DisableAlien=AdvRocketeerM2
+DisableAlien=AdvRocketeerM3
+DisableAlien=AdvSentryM1
+DisableAlien=AdvSentryM2
+DisableAlien=AdvSentryM3
+DisableAlien=AdvGunnerM1
+DisableAlien=AdvGunnerM2
+DisableAlien=AdvGunnerM3
+DisableAlien=LWDroneM1
+DisableAlien=LWDroneM2
+DisableAlien=AdvScout
+DisableAlien=AdvCommando
+DisableAlien=AdvShockTroop
+DisableAlien=AdvVanguard
+DisableAlien=AdvSergeantM1
+DisableAlien=AdvSergeantM2
+DisableAlien=AdvMECArcherM1
+DisableAlien=AdvMECArcherM2
+DisableAlien=ChryssalidSoldier
+DisableAlien=AdvMEC_M3_LW
+DisableAlien=ArchonM2_LW
+DisableAlien=AdvGeneralM1_LW
+DisableAlien=AdvGeneralM2_LW

+DisableAlien=TheLostGrappler
+DisableAlien=TheLostGrapplerHP2
+DisableAlien=TheLostGrapplerHP3
+DisableAlien=TheLostGrapplerHP4
+DisableAlien=TheLostGrapplerHP5
+DisableAlien=TheLostGrapplerHP6
+DisableAlien=TheLostGrapplerHP7
+DisableAlien=TheLostGrapplerHP8
+DisableAlien=TheLostGrapplerHP9
+DisableAlien=TheLostGrapplerHP10
+DisableAlien=TheLostGrapplerHP11
+DisableAlien=TheLostGrapplerHP12